天下首个家养梨基因组图谱绘制实现

By | 2020年7月26日

日前,《动物生物技巧杂志》正在线宣布了世界首个家养梨高品质基因组图谱。该钻研效果由中国农业迷信院果树钻研所钻研员曹玉芬团队以及中国迷信院遗传与发育生物学钻研所钻研员田志喜团队等协作实现。
 
  科研职员以山西杜梨为资料,连系PacBio三代测序、Bionano光学图谱、Hi-C技巧,组装了高品质的杜梨参考基因组序列,是我国正在梨基因组学钻研畛域又一严重钻研停顿。
 
  据引见,杜梨基因组组装巨细为532.7Mb,contig N50为1.57Mb,共有59552个卵白质编码基因以及247.4Mb反复序列被正文,经过BUSCO对基因组完好性进行评价,完好性达到95.9%。杜梨基因组中统共鉴定出573个NBS类型抗病基因,此中150个是TNL型抗病基因,正在已宣布的蔷薇科基因组中数目最多,诠释了杜梨作为家养种的强抗病性。
 
  正在驯化进程中,梨属动物果实的酸涩味逐步隐没,钻研发现,杜梨原花青素分解构造基因拷贝数明显多于白梨,影响了原花青素的积攒。同时花青素复原酶代谢路子是原花青素分解的惟一路子,山梨醇转运卵白跨膜转运多是影响可溶性无机物资积攒的次要要素。
 
  相干论文信息:https://doi.org/10.1111/pbi.13226